Les odeurs désagréables perçues sont dues essentiellement à trois gaz : le gaz carbonique (C02), l’Hydroxyde de soufre (H2S) et l’Ammoniac (NH3).
Ils sont le résultat de la dégradation de la matière organique en l'absence d'oxygène, dans les cuves et fosses des matériels d’assainissement. C'est donc en absence d'apport d'oxygène dans les dispositifs de traitement que les gaz se produisent.
L’hydroxyde de soufre (ou sulfure d'hydrogène) est le plus désagréable, il sent « l’œuf pourri ». Il est aussi appelé différemment selon les métiers : « Gaz des égoutiers », ou « Grisou » par les mineurs de fond. Dans ce cas, il est produit par la dégradation des matières organiques accumulées issues de la dégradation du charbon.
L'Ammoniac, lui, est dangereux pour les voies respiratoires.

• En cas de fortes températures
  Dans le cas de températures basses (en dessous de 7°), la formation de l'Hydroxyde Sulfurique (H2S) et de l'Ammoniac (NH3) est très faible.
  À partir de 15°, la production est importante. A noter que la température dans les fosses toutes eaux ou dispositifs d’Assainissement Non Collectif est de 10 à 22° selon la saison.
  À l’ouverture du couvercle d’une fosse toutes eaux mal ventilée, la concentration en H2S peut facilement dépasser les 500 ppm ("Partie par million").
• En cas de forte pression atmosphérique et selon la période de l'année
  Les mauvaises odeurs ressenties sont liées notamment à la pression atmosphérique et à la période de l'année.
  Pour comprendre, il faut savoir que quand « il fait lourd », c’est que la pression atmosphérique est élevée. Tous les gaz sans distinction sont plus souvent plaqués au sol.
  En revanche, en période pluvieuse et/ou venteuse, la pression atmosphérique est basse, et les gaz sont facilement chassés par le vent.
  Le problème pour l’usager d’un dispositif d’ANC, est que c’est par beau temps qu’il souhaite profiter de son jardin, et que c’est à ce moment-là que la gêne peut être la plus forte.

• Le Gaz Carbonique ou Oxyde de Carbone (C02)
  Il a une odeur légèrement irritante. Il est incolore et plus lourd que l’air (Densité 1,52). S’il a un effet « Gaz à effet de serre », il a aussi un rôle utile puisque en se déposant au sol, il contribue à la croissance des plantes et des végétaux qui l’assimilent pour se développer.
• L’Hydroxyde Sulfurique OU Sulfure d'Hydrogène (H2S)
  Il est incolore, inflammable et il a une odeur « d’œuf pourri » facilement reconnaissable. Il est lui aussi plus lourd que l’air (Densité 1,19) et s’accumule dans les parties basses non ventilées. À l’ouverture d’une fosse toutes eaux mal ventilée, sa concentration peut facilement dépasser les 500 ppm (partie par million). Il est produit par l’intermédiaire de bactéries anaérobies qui transforment les acides aminés soufrés issus de notre digestion en les associant à des atomes d’hydrogène pour former une molécule de H2S. Il est très dangereux et parfois mortel, les personnes présentant des difficultés respiratoires (asthme) ou des faiblesses oculaires doivent éviter tout contact avec ce gaz, même à faible dose.
• L’Ammoniac (NH3)
  L’ammoniac est bien connu pour sa capacité à récurer les éviers et les éléments de cuisine. Incolore et irritant, il a une odeur piquante à faible dose. À concentration plus élevée, il brûle les yeux et les poumons. Normalement, il n’est présent qu’en quantité infime dans l’atmosphère.
  Si on le perçoit, c’est qu’une source de production est proche. Il est le résultat de la dégradation des composés azotés présents dans les résidus de notre digestion.